Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms