Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YBX2Q9Y2T7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBX2Q9Y2T7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YBX2Q9Y2T7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YBX2Q9Y2T7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX2Q9Y2T7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms