Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSX2IPQ9Y2D8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSX2IPQ9Y2D8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms