Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHOC2Q9UQ13 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHOC2Q9UQ13 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHOC2Q9UQ13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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