Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX7Q9UNH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX7Q9UNH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms