Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ALKQ9UM73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ALKQ9UM73 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ALKQ9UM73 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALKQ9UM73 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ALKQ9UM73 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms