Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA2Q9UL42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNMA2Q9UL42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA2Q9UL42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms