Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPREB3Q9UKI3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPREB3Q9UKI3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms