Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3LQ9UJW3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms