Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCN11AQ9UI33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN11AQ9UI33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCN11AQ9UI33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN11AQ9UI33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms