Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED13Q9UHV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED13Q9UHV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED13Q9UHV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms