Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPXQ9UHP9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMPXQ9UHP9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms