Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFMBT1Q9UHJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms