Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGXB4Q9UGU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGXB4Q9UGU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGXB4Q9UGU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGXB4Q9UGU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGXB4Q9UGU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms