Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF1Q9UBU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXF1Q9UBU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXF1Q9UBU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms