Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LARSQ9P2J5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LARSQ9P2J5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARSQ9P2J5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms