Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT4Q9NX09 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT4Q9NX09 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT4Q9NX09 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDIT4Q9NX09 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT4Q9NX09 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms