Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER3Q9NUN7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACER3Q9NUN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACER3Q9NUN7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACER3Q9NUN7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms