Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC3Q9NUD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC3Q9NUD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC3Q9NUD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms