Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HOMER2Q9NSB8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOMER2Q9NSB8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms