Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF1Q9NS23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASSF1Q9NS23 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF1Q9NS23 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms