Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHAF3Q9NRP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDHAF3Q9NRP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms