Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL1Q9NR64 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL1Q9NR64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL1Q9NR64 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL1Q9NR64 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms