Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM7Q9NQW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM7Q9NQW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM7Q9NQW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM7Q9NQW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms