Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INCENPQ9NQS7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INCENPQ9NQS7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
INCENPQ9NQS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms