Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFYVE1Q9HBF4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFYVE1Q9HBF4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE1Q9HBF4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms