Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP13A3Q9H7F0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP13A3Q9H7F0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms