Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAB3GAP2Q9H2M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAB3GAP2Q9H2M9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAB3GAP2Q9H2M9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAB3GAP2Q9H2M9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RAB3GAP2Q9H2M9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAB3GAP2Q9H2M9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms