Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL25Q9H0H3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL25Q9H0H3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL25Q9H0H3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms