Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHARPINQ9H0F6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHARPINQ9H0F6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHARPINQ9H0F6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms