Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM39BQ9GZU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39BQ9GZU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM39BQ9GZU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms