Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NIF3L1Q9GZT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIF3L1Q9GZT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIF3L1Q9GZT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms