Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC90BQ9GZT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC90BQ9GZT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms