Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC39A8Q9C0K1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC39A8Q9C0K1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms