Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP44Q9C0F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP44Q9C0F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP44Q9C0F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP44Q9C0F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP44Q9C0F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP44Q9C0F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP44Q9C0F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP44Q9C0F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms