Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM6Q9C030 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM6Q9C030 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms