Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIH1Q9BYX4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIH1Q9BYX4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIH1Q9BYX4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIH1Q9BYX4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms