Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBX4Q9BYU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PBX4Q9BYU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PBX4Q9BYU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PBX4Q9BYU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms