Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS2Q9BXC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BBS2Q9BXC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS2Q9BXC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms