Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL3Q9BXA9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL3Q9BXA9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms