Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B5Q9BWJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B5Q9BWJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms