Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPAP1Q9BWH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPAP1Q9BWH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPAP1Q9BWH6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPAP1Q9BWH6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms