Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIFC3Q9BVG8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIFC3Q9BVG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KIFC3Q9BVG8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KIFC3Q9BVG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms