Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYSTQ99698 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LYSTQ99698 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYSTQ99698 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms