Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTERF1Q99551 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTERF1Q99551 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTERF1Q99551 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF1Q99551 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF1Q99551 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms