Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP19Q99542 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP19Q99542 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP19Q99542 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP19Q99542 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP19Q99542 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms