Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A2Q96QD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A2Q96QD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms