Protein–RNA interactions for Protein: Q96PY6

NEK1, Serine/threonine-protein kinase Nek1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1Q96PY6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK1Q96PY6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK1Q96PY6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEK1Q96PY6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEK1Q96PY6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK1Q96PY6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK1Q96PY6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK1Q96PY6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK1Q96PY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms