Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCEEQ96PE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCEEQ96PE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCEEQ96PE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCEEQ96PE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms