Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms